Не е извършен ДНК анализ на тленните останки, които предстои да бъдат върнати в България, за да се установи със сигурност дали принадлежат на цар Самуил. Известно е, че на остров Свети Ахил са погребани цар Самуил и семейството му.

Според историци операцията по връщането на останките не е добре подготвена. Предаването на костите изисква сериозна дипломация. Отбелязва се, че е отворена кутията на Пандора: проблемът не е само в това какво връщаме, а че липсва списък и никой не знае колко и какви са артефактите. Българската държава не е направила каталог и изследване на предметите, които действително принадлежат на гръцките манастири. Тези артефакти, които България ще върне на Гърция, са близо 112 години у нас и за тях няма достатъчно информация.

Преговорите за размяна на археологически находки между България и Гърция продължават и вероятно засягат и ръкописи. Смята се, че тленните останки на Самуил няма да бъдат положени у нас за постоянно. На капака на саркофага, в който ще бъдат поставени, не е изписана пълната титла на цар Самуил. Има мнение, че се бърза с организирането на връщането и размяната и че това има политически привкус.