Одитът на финансовото управление, строителството и поддръжката на републиканската пътна мрежа обхваща периода от 1 януари 2020 г. до 31 май 2026 г. Според констатациите за времето от началото на 2020 г. до 30 юни 2026 г. Агенция „Пътна инфраструктура“ е поела ангажименти за 18,24 млрд. лева, докато разходната ѝ база без средствата за персонал е около 11,4 млрд. лева. Това показва, че договори и допълнителни дейности са възлагани без предварително осигурено финансиране, което е довело до забавени плащания и до необходимост от последващо отпускане на средства.

При 139 от общо 213 договора за пътна поддръжка са подписани допълнителни споразумения. Общата им стойност достига 5,6 млрд. лева, което е със 78% повече от първоначално предвиденото. За периода са одобрени 2,11 млрд. лева допълнителни разходи за агенцията: 1,22 млрд. лева за текущ ремонт и поддържане на пътищата и близо 890 млн. лева за капиталови разходи.

Министър Иван Шишков свърза констатациите с протестите на строителните фирми през 2021 г., когато държавата е дължала над 800 млн. лева за възложени дейности без финансово обезпечение. По думите му същата практика се е повторила през 2024 и 2025 г. чрез анекси и договори, подписвани от редовни и служебни кабинети. Той определи това като „абсолютно същия сценарий от 2021 година“ и като повтарящ се модел на управление.

Одитът посочва още, че Управителният съвет на АПИ не е подписал сертификатите за част от извършените ремонти. При приемането им агенцията трябва да поиска фактури от фирмите, което би довело до отчитане на допълнителни задължения. Според Шишков това е част от прикрития дефицит и по подобни случаи са подавани сигнали до прокуратурата.

Като първа мярка е предложена нова структура на агенцията със съкращаване на щатни бройки, върху която да бъдат изградени нови правила за функциониране. В одита е отбелязано още, че АПИ няма разработени базови методики за работа.

По повод поръчката за обхода на Кресна от автомагистрала „Струма“ Шишков заяви, че параметрите и цената са били заложени от предходни правителства. Според него прекратяването на процедурата е можело да доведе до претенции за пропуснати ползи, съдебен спор и загуба на две години, както и до по-висока цена при нова обществена поръчка. Той не коментира зачестилите бомбени заплахи и извънредното кацане на самолет на летище „София“, като заяви, че темата е извън прекия му ресор.